马如龙为了查清暗算他及峨嵋派的背后势力，与峨嵋派新掌门许靖雯联手歼灭五毒教，单挑蜀中唐门，力拼三十年前崛起传奇人物风婆婆，在搭救四象门三娘子的过程中，金百合秘密组织逐渐浮现出来。金百合秘密组织为称霸武林，几十年来精心计划并逐步设施金百合计划，用施恩方式来帮助人实现一个最大愿望的手法钓取各派的重要人物，并成功的塑造了凌峰、金顶上人、五毒教主和唐门唐铃，最成功地策划就是那次宫廷政变，使得奕琛提早登上皇位。马如龙的出现打乱了金百合计划，摧毁了海盗船，击毙凌峰、扳倒了金顶上人，歼灭五毒教，并使唐门低头，迫使金百合秘密组织的首脑从幕后走向前台。